IgA肾病属于“尿血”“水肿”“瘀血”等病症的范畴。《素问·气厥论》曰：“胞移热于膀胱，则癃、溺血。”指出了其病因为热积膀胱而发生尿血。《金匮要略》中也明确指出：“热在下焦，则尿血。”巢元方认为尿血是“劳说而生客热、血渗热于胞。《医学入门》则提出尿血有暴热实热和虚损房劳两方面。
    另外，关于水肿一般认为与肺、脾、肾、三焦的功能失调有密切关系。其病机为阴阳气道不通，三焦不化，湿邪阻 滞而发病。如《内经》云：“其本在肾，其末在肺，皆积水也。”《素问·至真要大论》曰：“诸湿肿满，皆属于脾”。《灵枢·五癃津液别论》又指出：“阴阳气道不通，四海比塞，三焦不泻，津液不化，水谷并行肠胃之中，别于会肠，流于下焦，不得渗于膀胱，则下焦胀。水溢，则为水胀。”
    概括而言，该病的病因病机有以下几点
    （一）风热外袭：风热之邪、上犯于肺，日久不解，下传于膀胱，热积于下焦而发生尿血。或肺失宣降，不能通调水道，出现面部浮肿。（二）脾肾气虚：素体气虚或饮食不节，房劳过度，伤及脾肾而致脾不摄精，脾不升清而肾气不固，均可出现蛋白尿。脾气虚弱，临床上可见面色蛋黄，纳差乏力，腹胀痞满，大便稀散。肾气不固，临床上可见腰酸膝软，尿色清长多沫，夜尿频多；如果镜下血尿日久，伤及脾肾，气不摄血者，亦可有肉眼血尿出现。脉象沉弱，舌淡齿痕。
    （三）气阴两虚：属脾肾两虚，但脾虚是脾气虚，肾虚是肾阴虚，亦即脾肾气阴两虚，无论是脾肾气虚，或肝肾阴虚日久必然气损及阴、阴损及气，出现气阴两虚症。气虚易挟湿，阴虚生内热，湿热互结亦为气阴两虚证常见兼挟之邪实，病程日久，必有瘀滞，故亦多见瘀血，临床可见面色淡黄，全身乏力，腰酸膝软，手足心热，口干喜饮，舌质略红有齿痕，可有瘀斑、瘀点，脉象沉细。亦有病人可见畏寒而手足心热，口干饮水不多，大便先干后稀等特殊临床表现。
   （四）肝肾阴虚：中医辩证属肝肾阴虚者，阴虚生内热，肾为水脏，易与热相合而为湿热，故肝肾阴虚兼挟湿热者较为多见。临床上表现可有要酸腿软，眼目干涩，手足心热，口干喜饮，大便干结，小便黄赤，如果血热妄行则可出现血尿。脉象弦细。舌质暗红。
    （五）三焦气滞：三焦气滞多见水湿泛滥，症见全身高度水肿，可有胸水、腹水、尿少色黄，脉象沉弦，舌质暗红。